کلیسای جامع سیونی در خیابانی به همین نام و در یکی از قدیمی ترین مناطق تفلیس قرار دارد. با توجه به افسانه ها اولین کلیساها در بسیاری از مکان ها توسط پادشاه واختانگ گرگ سر در قرن پنجم بنا ساخته شد. اما ساخت این کلیسا صد سال بعد ما بین سال های ۵۷۰ تا ۵۸۰ توسط دفتر فئودالی گرجستان، اِریسمتاواری (Erismtavar)، گوآرام کوراپالاتی (Guaram Kurapalati) و عده ای از جمعیت شهر  آغاز گردید و سرانجام در سال ۶۲۰ به پایان رسید. همچنین بر اساس افسانه ها آرامگاه آدارنیس (Adarnese) و گرام (Guaram) در این کلیسا قرار دارد. کلیسای جامع سیونی چندین بار مورد حمله و ترمیم قرار گرفته است و گفته می شود که در زمان پادشاهی دیوید چهارم در سال ۱۱۲۲ زمانیکه تفلیس هنوز در دست گرجی ها بود، دوباره بازسازی شد. در سال ۱۲۲۶ در طی حمله مغول ها مجدداً آسیب دید، گنبدش هم به طور کامل تخریب گردید اما دوباره با دستور جلال الدین تحت بازسازی و مرمت قرار گرفت. در سال ۱۳۸۶ در دوران حکومت تیمور لنگ کلیسای سیونی یکبار دیگر  نیز مورد حمله قرار گرفت اما بازهم به دستور شاه الکساندر ترمیم شد.

این کلیسا بازهم در قرن هفدهم مورد حمله قرار گرفت، این بار هدف ایرانیان بود اما مجدداً فرآیند بازسازیش در سال ۱۶۵۷ انجام شد. این کلیسا متاسفانه بازهم در سال ۱۶۶۸ شاهد تخریب دیگری البته این بار بدست زلزله بود ولی بازهم تلاش برای بازسازی آن متوقف نگردید و دوباره ساخته شد. برای آخرین بار نیز در سال ۱۷۹۵ توسط آقامحمدخان قاجار تخریب و در سده نوزدهم مورد بازساری قرار گرفت